Dal 2014 al 2023, per la prima volta nella sua lunga storia, il Lazzaretto Vecchio è stato reso fruibile al pubblico: grazie all’impegno dei volontari dell’Archeoclub d'Italia Sede di Venezia e dell’Ekos Club, sulla base di un protocollo d’intesa siglato nel settembre 2013 dagli organi territoriali del Ministero della Cultura (prima Soprintendenza Archeologica del Veneto, poi Polo Museale del Veneto oggi Direzione Regionale Musei Veneto).
Quasi 20mila persone hanno così potuto visitare il Lazzaretto Vecchio, in una trentina di aperture straordinarie domenicali o in visite guidate organizzate per università e associazioni. Questa grande risposta della cittadinanza, unita all’attenzione dei media, nel 2020 ha quindi visto il Ministero riattivare il progetto del Museo Archeologico Nazionale della Laguna di Venezia cui l'isola è destinata dal 2000. Attualmente sono cioè in corso importanti attività di cantiere per una nuova fase di restauri.
In occasione dei 600 anni dall'istituzione del primo Lazzaretto del mondo, nel 2023 le ultime aperture straordinarie sono state previste per le Giornate Europee del Patrimonio, d'accordo con il MIC - Direzione regionale Musei Veneto.
La loggia su Bacino San Marco, il priorado, il portale in pietra d'Istria, i tezoni.